IRCICA, İslam medeniyeti tarihinde önemli yeri olan vakıf kurumu üzerine araştırma projeleri yürütmektedir. Bu bağlamda vakıflarla ilgili temel kaynaklar olan vakfiyeleri, faaliyet raporlarını ve başka belgeleri toplayarak bunlardan araştırmacılar için kaynak olabilecekleri yayınlamaktadır. Günümüz Müslüman ülkelerinin dışındaki ülkelerde ve bölgelerde kurulmuş olan vakıflara, bunlardan özellikle günümüz Müslüman azınlıklarına hizmet etmiş olanlara özel bir önem verilmektedir. Projede önce, Osmanlı döneminde Balkanlar bölgesinde kurulmuş– halen mevcut veya feshedilmiş – vakıflar ele alınmıştır. Balkanlarda Osmanlı Vakıfları serisi 2012’de Balkanlarda Osmanlı Vakıfları: Vakfiyeler, Bulgaristan başlıklı 3 ciltlik yayınla başlamıştır.
Projenin ikinci safhasında Yunanistan’daki vakıflar ele alınmıştır. 1427-1912 döneminde 54 ilçe ve köyde kurulmuş 487 vakfın vakfiyelerinin listesi, metinleri ve transkripsiyonları verilmiştir. Belgeler T.C. Vakıflar Genel Müdürlüğü arşivi, Osmanlı Arşivi ve Topkapı Sarayı arşivinden elde edilmiştir. Vakfiyeler temel alınarak derlenen bilgiler sistematik, başvuruyu kolaylaştırıcı tablolar halinde sunulmuş, böylece vakıflar, kurucuları, aldıkları bağışlar, amaçları, faaliyetleri, gelir kaynakları ve yardım görenler üzerine detaylı veriler kayda geçirilmiştir. Vakıflar ilçelerin isimlerine göre sıralanmıştır. Eserin en önemli özelliklerinden biri kapsamlı indeksidir.
